（三）
6月30日，段祺瑞率先进行了政府改组，这也算是以实际行动告诉外界人士，北京政府承认并且确实已经在按照旧《约法》工作。改组完成后以唐绍仪为外交总长，许世英为内务总长，陈锦涛为财政总长，程璧光为海军总长，张耀曾为司法总长，孙洪伊为教育总长，张国淦为农商总长，汪大燮为交通总长，段祺瑞自兼陆军总长。唐绍仪未到任以前陈锦涛暂兼外交总长，张耀曾未到任前，以张国淦兼司法总长。
而这个时候，黎元洪想要笼络护国军以牵制段祺瑞，于是致电护国军名将蔡锷的老师梁启超，先用“泰山北斗，景仰为劳”拍了一通马屁，又“欲以本府秘书长相屈，既无嫌乎夺情，且可资乎论道”。但梁启超是聪明人，随即婉言谢绝。但黎元洪与梁启超两人的通电往来，毕竟没有逃过段祺瑞的视线，他不得不加快解决护国军这件最棘手的事。
彼时护国军势力发展最快的当数云南、四川和广东，云南是护国军的老巢，蔡锷、唐继尧等经营多年，树大根深，难以根除。蔡锷虽然任四川督军兼省长但并没有完全掌控四川，北洋系的曹锟当时驻军在四川，刘存厚与北京政府也是眉来眼去，所以四川的形势更为乐观。而当时最混乱的要数广东，广东督军龙济光在袁世凯逝世前也宣布独立，不过他的独立是被迫的，因为他的邻居广西都督陆荣廷宣布独立了，而护国军的李烈钧又到了家门口，他只能选择独立以自保。
